Forståelsen af marginal parodontitis patogenese udvikles konstant i takt med den øgede indsigt i immunsystemets funktioner. Bakterier i den dentale plak kan i sig selv iværksætte nedbrydningsprocesser, men den overvejende del af den parodontale nedbrydning menes at ske indirekte ved bakteriernes igangsætning af nedbrydningsprocesser via inflammationssystemet. Om end disse processer er komplekse, er dele af dem afklaret. Værtsorganismens egne inflammatoriske reaktioner kan påvirkes af talrige forhold, herunder de tilstedeværende mikroorganismers egenskaber, værtsorganismens genetiske baggrund, medicinske sygdomme og livsstilsfaktorer. De herved etablerede individuelle modifikationer af den inflammatoriske reaktion kan formentlig forklare den betydelige variation i sygdomstilbøjelighed. Det spændende ved forståelsen af nedbrydningsprocesserne er, at der muligvis kan udvikles nye biologiske behandlingsmetoder, baseret på en medicinsk indgriben med det formål at begrænse de kataboliske dele af inflammationen. En sådan type behandling er udviklet for reumatoid arthritis og kan derfor også tænkes for aggressiv marginal parodontitis, om end der endnu ikke er overbevisende resultater.